Hier lebt die Mittelmeer-Mönchsrobbe, die als stark gefährdet eingestuft wird und bis vor Kurzem vom Aussterben bedroht war, wobei fast die Hälfte der verbleibenden Population in griechischen Gewässern lebt. Die Insel Piperi ist das Herzstück des Nationalparks und verfügt über eine der wenigen Fangverbotszonen in Griechenland innerhalb eines Radius von drei Seemeilen vor der Küste.
Sea Shepherd wird das Gebiet auf alle Bedrohungen hin überwachen, insbesondere während der Hochsaison im Sommer. Besonderes Augenmerk wird auf die illegale Fischerei (vor allem Speerfischen), unkontrolliertes Segeln in verbotenen Teilen des Gebiets (Aktivitäten, die das Ökosystem stören) und die Schädigung von Neptungras gelegt. Sea Shepherd wird mit dem Umweltministerium, der Agentur für natürliche Umwelt und Klimawandel (N.E.C.C.A.), der Verwaltungseinheit des Nationalparks von Alonissos, der Küstenwache und anderen lokalen Organisationen zusammenarbeiten.